El grupo de investigación PEDIAFE de la Fundación Santa Fe de Bogotá, reconocido por Colciencias en la categoría C, se dedica a estudiar las enfermedades que afectan a niños y adolescentes, con un enfoque en las enfermedades gastrointestinales. Sus líneas de investigación incluyen enfermedades inflamatorias intestinales, enfermedad celíaca, alergias alimentarias y desnutrición. El grupo colabora con otras instituciones y ha publicado en revistas científicas de prestigio. Sus investigaciones han mejorado el diagnóstico, tratamiento y prevención de enfermedades infantiles, además de desarrollar programas educativos para profesionales de la salud.